Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE8AO60658 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE8AO60658 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE8AO60658 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms