Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASA4O43374 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASA4O43374 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASA4O43374 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASA4O43374 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASA4O43374 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASA4O43374 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASA4O43374 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASA4O43374 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASA4O43374 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASA4O43374 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASA4O43374 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASA4O43374 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASA4O43374 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASA4O43374 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASA4O43374 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASA4O43374 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASA4O43374 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASA4O43374 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4O43374 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4O43374 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4O43374 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4O43374 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4O43374 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4O43374 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4O43374 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4O43374 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms