Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA2O43364 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms