Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTIFO43310 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTIFO43310 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTIFO43310 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTIFO43310 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTIFO43310 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTIFO43310 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTIFO43310 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTIFO43310 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTIFO43310 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTIFO43310 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTIFO43310 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTIFO43310 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTIFO43310 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTIFO43310 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTIFO43310 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTIFO43310 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTIFO43310 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTIFO43310 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTIFO43310 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTIFO43310 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTIFO43310 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTIFO43310 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTIFO43310 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTIFO43310 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTIFO43310 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTIFO43310 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTIFO43310 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTIFO43310 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTIFO43310 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTIFO43310 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTIFO43310 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTIFO43310 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTIFO43310 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTIFO43310 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTIFO43310 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTIFO43310 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTIFO43310 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTIFO43310 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTIFO43310 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTIFO43310 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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