Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms