Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNN4O15554 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms