Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3FO00303 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3FO00303 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3FO00303 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3FO00303 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3FO00303 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3FO00303 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3FO00303 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3FO00303 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3FO00303 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3FO00303 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3FO00303 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3FO00303 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3FO00303 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms