Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLDN34H7C241 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN34H7C241 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms