Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQF6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQF6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQF6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQF6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQF6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQF6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQF6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQF6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQF6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQF6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQF6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQF6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQF6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQF6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQF6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQF6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQF6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQF6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQF6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQF6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQF6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQF6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQF6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQF6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQF6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQF6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQF6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQF6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQF6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQF6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQF6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQF6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQF6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQF6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQF6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQF6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms