Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms