Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AP000821.1-201ENST00000567082 1909 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 FP565260.3-202ENST00000623960 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC007277.1-201ENST00000428156 2189 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 TROVE2-203ENST00000367444 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 MYO19-213ENST00000614623 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AL606970.1-201ENST00000445442 2559 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 RFC3-201ENST00000380071 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SYPL2-201ENST00000369872 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 CDH5-201ENST00000341529 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LILRA1-202ENST00000453777 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 A2M-AS1-201ENST00000499762 2192 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LRP1-207ENST00000554174 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 GNL3-201ENST00000394799 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 PRAMEF18-202ENST00000624297 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LRTOMT-207ENST00000435085 3194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 PAX9-201ENST00000361487 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 MRPL24-201ENST00000361531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 PRKN-210ENST00000612540 603 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 FAM78A-202ENST00000372269 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 NVL-201ENST00000281701 3123 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AIF1L-207ENST00000372309 3515 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC100868.1-201ENST00000262283 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 KYAT3-201ENST00000260508 2070 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 EEF2KMT-202ENST00000458008 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 LYSMD3-204ENST00000509384 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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