Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC097372.1-201ENST00000636502 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PIP4K2C-203ENST00000540759 2876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 GCM1-201ENST00000259803 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PKP2-202ENST00000340811 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FCHSD1-201ENST00000435817 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NRF1-205ENST00000393232 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MIER1-203ENST00000357692 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CD22-205ENST00000544992 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MTA2-202ENST00000524902 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PAK6-213ENST00000560346 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KLHL30-AS1-201ENST00000623136 3106 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ECE1-202ENST00000357071 3763 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NIF3L1-204ENST00000409357 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC096636.1-201ENST00000625140 3618 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ADAMTSL1-201ENST00000276935 2906 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SAMHD1-201ENST00000262878 4784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 POLDIP3-205ENST00000451060 3491 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 VWA5B1-202ENST00000375079 3859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC008132.1-201ENST00000419447 2068 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TCF19-201ENST00000376255 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC130456.2-201ENST00000563613 1937 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KIAA1191-213ENST00000620366 2452 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GIT2-209ENST00000547815 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GPATCH1-201ENST00000170564 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ELF5-205ENST00000532417 2330 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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LSAMPQ13449 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 C8B-205ENST00000535057 2289 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TTC12-210ENST00000483239 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CDK13-206ENST00000611390 2222 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 USP6NL-206ENST00000609853 1748 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UPK1B-201ENST00000264234 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC139493.2-201ENST00000508056 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 OSBPL9-213ENST00000486942 2529 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CASP7-211ENST00000621345 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ST5-207ENST00000526099 2404 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PAMR1-208ENST00000621476 2842 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 IDH1-201ENST00000345146 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC093627.7-201ENST00000567533 3208 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MYO7A-211ENST00000620575 4016 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 EIF3CL-202ENST00000398944 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 S1PR3-201ENST00000358157 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC068473.3-202ENST00000589723 4167 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RHO-201ENST00000296271 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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