Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 FP565260.3-202ENST00000623960 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 LRRC2-201ENST00000296144 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 APP-201ENST00000346798 3467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 NCALD-202ENST00000311028 3655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AC087741.1-201ENST00000570309 4399 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ADGRF3-201ENST00000311519 3240 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MX1-201ENST00000288383 2733 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 CHMP1B-201ENST00000526991 3054 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 EXOC7-205ENST00000405575 2208 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 SERPINA5-203ENST00000553780 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ST5-207ENST00000526099 2404 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 RARB-203ENST00000437042 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 EEF2KMT-202ENST00000458008 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 PCDHGB5-201ENST00000617380 4578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AC130456.7-201ENST00000623838 1256 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 KNSTRN-203ENST00000448395 1464 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 BTNL3-201ENST00000342868 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 TRIM23-203ENST00000381018 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AC099489.3-201ENST00000572950 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ZFP1-203ENST00000464850 3067 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 DUXAP8-202ENST00000413768 2102 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 SULT1A4-201ENST00000360423 1390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 BMP4-202ENST00000417573 1784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 C16orf82-202ENST00000505035 2459 ntAPPRIS P5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OPALINQ96PE5 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms