Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TTC12-219ENST00000529221 2315 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CALML4-204ENST00000448060 2520 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TRIM26-268ENST00000454678 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 EPSTI1-202ENST00000313640 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF641-203ENST00000544117 7819 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ITIH4-202ENST00000406595 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ACSM2B-202ENST00000414188 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GFI1B-201ENST00000339463 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 HHAT-208ENST00000545154 3507 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 C8orf34-201ENST00000325233 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MAP3K7CL-207ENST00000399934 1964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SRRT-213ENST00000611405 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LRRIQ4-201ENST00000340806 1827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LYPD6-203ENST00000409381 3578 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KRT25-201ENST00000312150 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 USP3-213ENST00000559711 1693 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CDH5-201ENST00000341529 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL390838.1-201ENST00000423515 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 BCO1-201ENST00000258168 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 DIO1-202ENST00000361921 1861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 WDR20-204ENST00000342702 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NEFL-204ENST00000639464 3205 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CR1L-203ENST00000508064 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 HOXA-AS3-202ENST00000518947 3992 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MUC4-204ENST00000349607 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NCALD-202ENST00000311028 3655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PLEKHM1P1-204ENST00000582201 3166 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RIPOR3-201ENST00000045083 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 EIF2B2-201ENST00000266126 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ITGA11-201ENST00000315757 3955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RPH3A-213ENST00000548866 2429 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ANAPC16-205ENST00000621663 3567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC135048.4-201ENST00000624286 3641 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 BICD1-201ENST00000281474 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NOBOX-202ENST00000483238 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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