Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYV3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYV3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYV3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYV3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYV3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYV3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYV3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GYV3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYV3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V9GYV3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms