Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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