Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SERP1Q9Y6X1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms