Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms