Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms