Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP15Q9Y4E8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms