Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms