Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms