Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAN1Q9Y2M0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAN1Q9Y2M0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAN1Q9Y2M0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAN1Q9Y2M0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAN1Q9Y2M0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAN1Q9Y2M0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms