Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKBQ9Y259 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms