Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SORCS3Q9UPU3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms