Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ERG28Q9UKR5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms