Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF3C4Q9UKN8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms