Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL1Q9UKG1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL1Q9UKG1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL1Q9UKG1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL1Q9UKG1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL1Q9UKG1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL1Q9UKG1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL1Q9UKG1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms