Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms