Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms