Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGXB4Q9UGU5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms