Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NKX1-2Q9UD57 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms