Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms