Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms