Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB20Q9NX57 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms