Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms