Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms