Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN4Q9NQC3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms