Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms