Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC90BQ9GZT6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms