Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR88Q9GZN0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms