Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM6Q9C030 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms