Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF1Q9BYJ9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
YTHDF1Q9BYJ9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms