Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms