Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms