Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms