Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY3Q9BT09 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms