Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf78Q9BR46 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C20orf78Q9BR46 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms