Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms