Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms